Su nombre fue tomado de la sobrina del cacique calarcá, perteneciente a la tribu de los pijaos  de la cultura indígena Quimbaya, quienes inicialmente habitaron este municipio. El barrio "Ciudad Boquia" inicia con 597 soluciones de vivienda y fue inaugurado el 28 de junio de 1991, por el entonces ministro de desarrollo doctor Ernesto  Samper Pizano y bajo el gobierno del presidente doctor Cesar Gaviria Trujillo.

A partir de esta fecha comienza la adjudicación de viviendas, calculando una población escolar promedio de 800 menores para educación básica primaria, razón por la cual surge la necesidad de tener dentro del barrio una institución educativa para evitar los peligros que ocasionan el desplazamiento a otras instituciones educativas y la erogación de los gastos que ello incluye. Ante esta gran dificultad surgió al interior de la primera junta  de acción comunal y demás habitantes del sector, la idea  de realizar un proyecto de  construcción y dotación de una institución educativa, acorde con las necesidades de la época.   

El proyecto fue elaborado y presentado a la secretaria de Educación Municipal de Pereira, allí contó con gran apoyo, dándose comienzo al proceso de gestión y dinamismo, requerido para la dotación de esta institución educativa. Entre tanto, la comunidad requería una solución a corto plazo, por lo cual solicitó al gerente del  INURBE, el préstamo de la casa modelo de la urbanización Ciudad Boquia, lo cual fue autorizado. Nace el instituto Docente Ciudad Boquia. En 1992, debido a que fueron adjudicadas nuevas soluciones de vivienda, surge la necesidad de nuevos cupos escolares y de ampliar la planta de personal docente al igual que la infraestructura que permitiera albergar un mayor número  de estudiantes. Entre 1994 y 1996 es construida la actual planta física y mediante el acuerdo número  51 del Honorable Consejo Municipal, se crea el colegio Ciudad Boquia.